O visitante do Museu da Água além das experiências virtuais, poderá fazer uma caminhada pela trilha, localizada o lado do prédio principal, onde conhecerá a importância da mata ciliar para a perenidade de um manancial
Conscientização ambiental é um dos fatores principais que levaram a criação do Museu da Água, sendo assim a experiências junto a natureza também apresenta um pouco da fauna e flora existente neste pequeno bioma.
A trilha é localizada em uma das poucas florestas com remanescentes de Mata Atlântica e Cerrado do Estado de São Paulo e Indaiatuba.